Come ho postato prima (http://blogs.ugidotnet.org/BabbaBlog/archive/2005/08/22/24979.aspx) mi hanno indicato la soluzione al mio interrogativo (ovviamente era banale, ma mi era sfuggita...)
Il mio quesito era "Possono convivere soluzioni Office realizzate con il framework 1.1 e 2?"
La risposta è si... basta settare correttamente le policy anche per il framework 2.
Le vecchie soluzioni già realizzate infatti verranno fatte girare dal nuovo framework (da quanto ho provato senza alcun problema).
L'unica cosa da ricordarsi è in fase di debug di cambiare il config di word ed excel come indicato nel post precedente.